Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atf3Q60765 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atf3Q60765 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atf3Q60765 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Atf3Q60765 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Atf3Q60765 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Atf3Q60765 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Atf3Q60765 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Atf3Q60765 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Atf3Q60765 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atf3Q60765 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atf3Q60765 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Atf3Q60765 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Atf3Q60765 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Atf3Q60765 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atf3Q60765 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atf3Q60765 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atf3Q60765 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Atf3Q60765 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atf3Q60765 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms