Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csnk2a1Q60737 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csnk2a1Q60737 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csnk2a1Q60737 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csnk2a1Q60737 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnk2a1Q60737 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk2a1Q60737 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk2a1Q60737 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms