Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nr1h2Q60644 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr1h2Q60644 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nr1h2Q60644 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr1h2Q60644 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Nr1h2Q60644 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h2Q60644 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms