Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp13a3Q5XF89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp13a3Q5XF89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp13a3Q5XF89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp13a3Q5XF89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp13a3Q5XF89 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp13a3Q5XF89 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp13a3Q5XF89 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp13a3Q5XF89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atp13a3Q5XF89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp13a3Q5XF89 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp13a3Q5XF89 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms