Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD0

Rflnb, Refilin-B, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnbQ5SVD0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RflnbQ5SVD0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RflnbQ5SVD0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RflnbQ5SVD0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RflnbQ5SVD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RflnbQ5SVD0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RflnbQ5SVD0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RflnbQ5SVD0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RflnbQ5SVD0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RflnbQ5SVD0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.9 ms