Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zzef1Q5SSH7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zzef1Q5SSH7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zzef1Q5SSH7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zzef1Q5SSH7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zzef1Q5SSH7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zzef1Q5SSH7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zzef1Q5SSH7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms