Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sun3Q5SS91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sun3Q5SS91 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sun3Q5SS91 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sun3Q5SS91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sun3Q5SS91 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sun3Q5SS91 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sun3Q5SS91 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sun3Q5SS91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sun3Q5SS91 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms