Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trdv2-2Q5R1A4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trdv2-2Q5R1A4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trdv2-2Q5R1A4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trdv2-2Q5R1A4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trdv2-2Q5R1A4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms