Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm6bQ5NCY0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm6bQ5NCY0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm6bQ5NCY0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm6bQ5NCY0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kdm6bQ5NCY0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Kdm6bQ5NCY0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Kdm6bQ5NCY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm6bQ5NCY0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm6bQ5NCY0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm6bQ5NCY0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kdm6bQ5NCY0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm6bQ5NCY0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Kdm6bQ5NCY0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm6bQ5NCY0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Kdm6bQ5NCY0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm6bQ5NCY0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms