Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc1Q5NCF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc1Q5NCF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc1Q5NCF2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc1Q5NCF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms