Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rassf5Q5EBH1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rassf5Q5EBH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf5Q5EBH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rassf5Q5EBH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rassf5Q5EBH1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rassf5Q5EBH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rassf5Q5EBH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rassf5Q5EBH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms