Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Afap1l2Q5DTU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Afap1l2Q5DTU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Afap1l2Q5DTU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Afap1l2Q5DTU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Afap1l2Q5DTU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afap1l2Q5DTU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afap1l2Q5DTU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afap1l2Q5DTU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afap1l2Q5DTU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afap1l2Q5DTU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afap1l2Q5DTU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afap1l2Q5DTU0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms