Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKR2

Slc9b2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b2Q5BKR2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9b2Q5BKR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9b2Q5BKR2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9b2Q5BKR2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc9b2Q5BKR2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9b2Q5BKR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9b2Q5BKR2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9b2Q5BKR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms