Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Urb1Q571H0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb1Q571H0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Urb1Q571H0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Urb1Q571H0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb1Q571H0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Urb1Q571H0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Urb1Q571H0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb1Q571H0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.7 ms