Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd28Q505D1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ankrd28Q505D1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd28Q505D1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd28Q505D1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd28Q505D1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ankrd28Q505D1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd28Q505D1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms