Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa20Q45VN2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa20Q45VN2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa20Q45VN2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa20Q45VN2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms