Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacs2Q3V3Q7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacs2Q3V3Q7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacs2Q3V3Q7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pacs2Q3V3Q7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pacs2Q3V3Q7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms