Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1810049J17RikQ3V2G9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1810049J17RikQ3V2G9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
1810049J17RikQ3V2G9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1810049J17RikQ3V2G9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810049J17RikQ3V2G9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810049J17RikQ3V2G9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810049J17RikQ3V2G9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms