Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Garnl3Q3V0G7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Garnl3Q3V0G7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Garnl3Q3V0G7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Garnl3Q3V0G7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Garnl3Q3V0G7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garnl3Q3V0G7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Garnl3Q3V0G7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms