Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lrrc55Q3UY51 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc55Q3UY51 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc55Q3UY51 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc55Q3UY51 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc55Q3UY51 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc55Q3UY51 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc55Q3UY51 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc55Q3UY51 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms