Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C87499Q3UX49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C87499Q3UX49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C87499Q3UX49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C87499Q3UX49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C87499Q3UX49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C87499Q3UX49 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
C87499Q3UX49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C87499Q3UX49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C87499Q3UX49 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C87499Q3UX49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C87499Q3UX49 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C87499Q3UX49 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C87499Q3UX49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C87499Q3UX49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms