Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn4Q3UV66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn4Q3UV66 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slfn4Q3UV66 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn4Q3UV66 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn4Q3UV66 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn4Q3UV66 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slfn4Q3UV66 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn4Q3UV66 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms