Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms