Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Obox3Q3UT54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Obox3Q3UT54 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Obox3Q3UT54 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Obox3Q3UT54 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Obox3Q3UT54 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Obox3Q3UT54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Obox3Q3UT54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms