Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
B3gnt6Q3USF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B3gnt6Q3USF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B3gnt6Q3USF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B3gnt6Q3USF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B3gnt6Q3USF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
B3gnt6Q3USF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
B3gnt6Q3USF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms