Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cracr2aQ3UP38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cracr2aQ3UP38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cracr2aQ3UP38 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cracr2aQ3UP38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cracr2aQ3UP38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cracr2aQ3UP38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cracr2aQ3UP38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cracr2aQ3UP38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms