Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppp1r12cQ3UMT1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r12cQ3UMT1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r12cQ3UMT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r12cQ3UMT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r12cQ3UMT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r12cQ3UMT1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r12cQ3UMT1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppp1r12cQ3UMT1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppp1r12cQ3UMT1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppp1r12cQ3UMT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ppp1r12cQ3UMT1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms