Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BtrcQ3ULA2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BtrcQ3ULA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BtrcQ3ULA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BtrcQ3ULA2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BtrcQ3ULA2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BtrcQ3ULA2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BtrcQ3ULA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BtrcQ3ULA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BtrcQ3ULA2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms