Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpr55Q3UJF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpr55Q3UJF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpr55Q3UJF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpr55Q3UJF0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpr55Q3UJF0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpr55Q3UJF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms