Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnep1r1Q3UJ81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnep1r1Q3UJ81 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnep1r1Q3UJ81 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnep1r1Q3UJ81 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnep1r1Q3UJ81 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms