Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dtx3lQ3UIR3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dtx3lQ3UIR3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dtx3lQ3UIR3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Dtx3lQ3UIR3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dtx3lQ3UIR3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dtx3lQ3UIR3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dtx3lQ3UIR3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dtx3lQ3UIR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dtx3lQ3UIR3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms