Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf44Q3UHJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf44Q3UHJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf44Q3UHJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf44Q3UHJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf44Q3UHJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf44Q3UHJ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf44Q3UHJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf44Q3UHJ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf44Q3UHJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms