Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfgef3Q3UGY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfgef3Q3UGY8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfgef3Q3UGY8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfgef3Q3UGY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfgef3Q3UGY8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfgef3Q3UGY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfgef3Q3UGY8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms