Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6K5

Spata6, Spermatogenesis-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6Q3U6K5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Spata6Q3U6K5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spata6Q3U6K5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spata6Q3U6K5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spata6Q3U6K5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata6Q3U6K5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata6Q3U6K5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata6Q3U6K5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms