Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssbp4Q3U4B1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssbp4Q3U4B1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssbp4Q3U4B1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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