Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdkl4Q3TZA2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdkl4Q3TZA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdkl4Q3TZA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdkl4Q3TZA2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkl4Q3TZA2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkl4Q3TZA2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms