Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccndbp1Q3TVC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccndbp1Q3TVC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccndbp1Q3TVC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccndbp1Q3TVC7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccndbp1Q3TVC7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms