Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Ccdc136Q3TVA9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
Ccdc136Q3TVA9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Ccdc136Q3TVA9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Ccdc136Q3TVA9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Ccdc136Q3TVA9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ccdc136Q3TVA9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Ccdc136Q3TVA9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Ccdc136Q3TVA9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Ccdc136Q3TVA9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Ccdc136Q3TVA9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Ccdc136Q3TVA9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Ccdc136Q3TVA9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ccdc136Q3TVA9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Ccdc136Q3TVA9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Ccdc136Q3TVA9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Ccdc136Q3TVA9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Ccdc136Q3TVA9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Ccdc136Q3TVA9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ccdc136Q3TVA9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Ccdc136Q3TVA9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Ccdc136Q3TVA9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Ccdc136Q3TVA9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Ccdc136Q3TVA9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Ccdc136Q3TVA9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Ccdc136Q3TVA9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Ccdc136Q3TVA9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ccdc136Q3TVA9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Ccdc136Q3TVA9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Ccdc136Q3TVA9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Ccdc136Q3TVA9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Ccdc136Q3TVA9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
Ccdc136Q3TVA9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Ccdc136Q3TVA9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Ccdc136Q3TVA9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ccdc136Q3TVA9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Ccdc136Q3TVA9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms