Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CiartQ3TQ03 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CiartQ3TQ03 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CiartQ3TQ03 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CiartQ3TQ03 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CiartQ3TQ03 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CiartQ3TQ03 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CiartQ3TQ03 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CiartQ3TQ03 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CiartQ3TQ03 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CiartQ3TQ03 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CiartQ3TQ03 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms