Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrx1Q3TL44 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlrx1Q3TL44 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrx1Q3TL44 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrx1Q3TL44 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Nlrx1Q3TL44 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrx1Q3TL44 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nlrx1Q3TL44 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nlrx1Q3TL44 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms