Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trappc13Q3TIR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trappc13Q3TIR1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc13Q3TIR1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc13Q3TIR1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc13Q3TIR1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc13Q3TIR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc13Q3TIR1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms