Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem104Q3TB48 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem104Q3TB48 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem104Q3TB48 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem104Q3TB48 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem104Q3TB48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem104Q3TB48 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms