Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAA7

Stk11ip, Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk11ipQ3TAA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stk11ipQ3TAA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stk11ipQ3TAA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stk11ipQ3TAA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stk11ipQ3TAA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stk11ipQ3TAA7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stk11ipQ3TAA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stk11ipQ3TAA7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stk11ipQ3TAA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stk11ipQ3TAA7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Stk11ipQ3TAA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Stk11ipQ3TAA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms