Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA6

Helq, Helicase POLQ-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelqQ2VPA6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HelqQ2VPA6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HelqQ2VPA6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelqQ2VPA6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HelqQ2VPA6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HelqQ2VPA6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HelqQ2VPA6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms