Protein–RNA interactions for Protein: Q283N4

Urad, 2-oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UradQ283N4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UradQ283N4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UradQ283N4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UradQ283N4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UradQ283N4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UradQ283N4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UradQ283N4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UradQ283N4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UradQ283N4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UradQ283N4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UradQ283N4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UradQ283N4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UradQ283N4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UradQ283N4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UradQ283N4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UradQ283N4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UradQ283N4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UradQ283N4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UradQ283N4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UradQ283N4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UradQ283N4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UradQ283N4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms