Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd300lgQ1ERP8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd300lgQ1ERP8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd300lgQ1ERP8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd300lgQ1ERP8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd300lgQ1ERP8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd300lgQ1ERP8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd300lgQ1ERP8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms