Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
VgfQ0VGU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
VgfQ0VGU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VgfQ0VGU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VgfQ0VGU4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VgfQ0VGU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VgfQ0VGU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VgfQ0VGU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms