Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ttc39dQ0VF76 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttc39dQ0VF76 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc39dQ0VF76 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc39dQ0VF76 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc39dQ0VF76 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc39dQ0VF76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc39dQ0VF76 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ttc39dQ0VF76 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc39dQ0VF76 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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