Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpne7Q0VE82 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cpne7Q0VE82 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne7Q0VE82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpne7Q0VE82 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne7Q0VE82 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne7Q0VE82 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cpne7Q0VE82 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne7Q0VE82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cpne7Q0VE82 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms