Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Lrriq1Q0P5X1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Lrriq1Q0P5X1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
Lrriq1Q0P5X1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Lrriq1Q0P5X1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Lrriq1Q0P5X1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Lrriq1Q0P5X1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
Lrriq1Q0P5X1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Lrriq1Q0P5X1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Lrriq1Q0P5X1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Lrriq1Q0P5X1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Lrriq1Q0P5X1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
Lrriq1Q0P5X1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Lrriq1Q0P5X1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Lrriq1Q0P5X1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Lrriq1Q0P5X1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Lrriq1Q0P5X1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms