Protein–RNA interactions for Protein: Q0P521

1700013D24Rik, MCG1037134, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013D24RikQ0P521 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
1700013D24RikQ0P521 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700013D24RikQ0P521 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700013D24RikQ0P521 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700013D24RikQ0P521 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
1700013D24RikQ0P521 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700013D24RikQ0P521 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700013D24RikQ0P521 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700013D24RikQ0P521 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms